本季讲述了赛尔号在得到无尽能源后，踏上回地球的归途完成使命；不料却因为遇到三巨头的阻碍，失控的赛尔号意外误入了传说中恐怖的巴斯星。

以南京雨花石为动漫造型，讲述了神奇的雨花石精灵带着一个机智可爱的小学生雨雨穿越时光旅行，展现一个神奇的科幻世界：史前动植物的消失，能源的危机，海啸、火山的形成，大裂谷的跋涉和冰川的消融等等，一切都是那样的有诱惑力。他们一起经历了地球46亿年的兴衰变迁，险象环生、惊险刺激，展现了波澜壮阔的地球演变史。

妮可在海底探索时结识了不少小伙伴：活泼的海鸥、憨态可掬的海狮和可爱的章鱼。他们一起乘着妮可的潜水艇在海底四处探索、冒险，他们穿梭珊瑚丛，看到可爱的小丑鱼群，有时他们还会遇到正在捕猎的大白鲨，这着实把大伙儿都下了一跳......小观众们跟随者这支海洋探险小队，会领略海洋这个生命摇篮的奇妙，从而爱上海洋，从小树立保护海洋的观念。

水世界、陆世界和树世界共同构建了一个美丽而宁静的生态，许多生物和人类共同生活在这里，彼此影响，和谐共存。在这个庞大的世界里，还活跃着一只特殊的队伍——环保特攻队。他们肩负着一个非常重要的使命——服务、保护和维护包括湖泊，湿地，森林及泗洪城在内的当地生态系统。